W starej skopijskiej katedrze, zbudowanej w 1902 roku, a zburzonej po trzęsieniu ziemi w 1963 roku, istniał chór. Mówi nam o tym także święta Matka Teresa, która sama w nim śpiewała. Historia świadczy, że ważny wkład w rozwój chóru katedralnego wniosły siostry od Świętego Krzyża, które prowadziły go aż do 2000 roku: s. Emanuela, s. Cecylia i s. Natanaela. Później przez pewien czas chór prowadziła pani Milica Đekić. Za czasów s. Natanaeli Palić, a dzięki ks. prał. Antunowi Cirimoticiowi, do chóru katedralnego dołączyła jako organistka prof. Marija Dokuzova, która i dziś aktywnie w nim działa. Na prośbę ówczesnego proboszcza katedralnego, ks. Nikoli Čibaricia, chór przejęła s. Tatjana Atanasova, siostra ze zgromadzenia Eucharystek, która prowadzi go do dziś.
Chór katedralny regularnie wnosi swój wkład, śpiewając podczas niedzielnych celebracji liturgicznych oraz uroczystych Mszy Świętych w dni świąteczne. Chór liczy około dwudziestu stałych członków, którzy przychodzą na próby dwa razy w tygodniu: w każdą środę i sobotę o godzinie 19:00.